喉部论喉症喉症总论辨喉症经络治法喉科辨症双松症单松症双燕子症单燕子症双鹅症单鹅症双缠症单缠症悬蜞症合架症圹症瘰症乘枕症乘颚症斗底症HT症联珠症破头症掩头症大头症穿额症鱼鳞症玉笋症莲花症梅花症黑疔症抢食
卷第一（求端探本）凡一门求子方论卷第二（方书叙例）凡十三门叙初有小儿方第一叙小儿有病与大人不殊第二叙小儿方可酌量药品分两第三叙小儿有病宜早治第四叙调理小儿第五叙修合药第六叙用药第七叙小儿气弱不可容易吐
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
本草图经序本草图经奏敕玉石上品卷第一玉屑玉泉（图缺），文具玉屑条下。丹砂空青曾青（图缺），文附空青条下。绿青扁青，文具绿青条下。石胆云母石钟乳殷孽，文具石钟乳条下。孔公孽，文具石钟乳条下。石花，文具石
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
简介序第一章·伤寒要义第二章·六经方药第三章·表里寒热第四章·气血虚实第五章·伤寒诊法第六章·伤寒脉舌第七章·伤寒本证第八章·伤寒兼证第九章·伤寒夹证第十章·伤寒坏证第十一章·伤寒复证第十二章·调理诸
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方
序一序二卷上疗发背痈疽灸法用药第一痈疽备论第二痈疽灸法论第三骑竹马灸法第四论隔蒜灸得效第五背疽肿漫寻头灸法第六蒜饼施用分其轻重第七灸法要论第八痈疽灼艾痛痒论第九脑疽灸法第十痈疽既灸服药护脏腑论第十一马
刘序凡例正面图（图缺）背面图（图缺）指节图灸盏图灸药神方人神在曰不宜灸单十二时人神所在不宜针灸歌十二支曰人神所在不宜针灸歌十干曰人神所在不宜针灸歌尻神图九宫尻神歌应灸七十症中风尸厥偏风眩晕痿症痹症劳伤