第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
序序序序自序卷上参合六十年客气旁通图运气便览五运六气寸尺不应药之主宰运气之变成疾论四时运气论疫与伤寒似同而异论伤寒无斑疹疫疹穷源疫疹案论疫疹之脉不宜表下论疫疹因乎气运疫疹之症头痛倾侧骨节烦痛腰如被杖遍
类证普济本事方
幼科类萃
病机气宜保命集
通俗序壶天性果女丹十则（一卷）第一则·养真化气第二则·九转炼形第三则·运用火符第四则·默运胎息第五则·广立功行第六则·志坚行持第七则·调养元神第八则·移神出壳第九则·待度飞升第十则·了道成真女金丹序上
环周图说难上卷本输穴说难手太阴肺经五穴一、少商（井穴）二、鱼际（荥穴）三、大渊（俞穴）四、经渠（经穴）五、尺泽（合穴）手阳明大肠经六穴一、商阳（井穴）二、二间（荥穴）三、三间（俞穴）四、合谷（原穴）五
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
马序王序一夏序王序二曹序许序陶序秦序丁甘仁先生别传卷一伤寒案风温案暑温案湿温案痉症案卷二霍乱案泄泻案痢疾案疟疾案喉痧案附∶白喉案附∶痧后案卷三中风案类中案神志案内伤杂病案附∶不寐案附∶肝气肝阳案附∶头
序卷之一温邪门暑邪门伏暑门疟疾门痢疾门黄胆门卷之二中风门肝风痰火门虚劳门吐血门臌胀水肿门卷之三积聚门（附虫积）脘腹痛门噎膈反胃门三消门痰饮门痰喘门卷之四咳嗽门疝气门遗精淋浊门痉厥门杂病门妇人门产后门幼