序自序自序杂症大小合参凡例（小引）杂症大小合参凡例痘疹全集凡例杂症痘疹药性主治合参凡例杂症大小合参卷首上 内经纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论
伤寒杂病论桂林古本
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序序例第一案~第九案第十案~第十九案第二十案~第二十九案第三十案~第三十九案第四十案~第四十九案后记
简介祖剂细目祖齐小叙卷之一卷之二卷之三卷之四
序卷之一风病诸候上（凡二十九论）一、中风候二、风候三、风口噤候四、风舌强不得语候五、风失音不语候六、贼风候七、风痉候八、风角弓反张候九、风口候十、柔风候十一、风痱候十二、风退候十三、风偏枯候十四、风四
寿亲养老新书
湿热病篇
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消