序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
简介序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十
秘藏膏丹丸散方剂
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
旅舍备要方
孙真人《千金方》论王唯一《明堂铜人灸经》量同身寸法第一正坐伸臂法第二揣骨定穴高下法第三定穴相去远近法第四钩股按穴取平法第五参验求穴法第六坐点坐灸法第七石用之取穴别法第八叶潘等取穴别法第九灸讫补养法第十
序凡例自记卷一病机赋经论总抄药性歌（凡二百四十首 添加）卷二真中风一中腑中脏类中风二气虚 附血虚。中气痰火湿痰中寒三外因内因暑证四动而得之静而得之湿证五外因内因燥证六风燥火燥虚燥火证七君火相火郁火五志
本草纲目别名录
序祭神应王文岐伯阴阳脉例洁古老人内伤三阴例海藏老人内伤三阴例伤在少阴伤在太阳阴阳寒热各从类生服药同象伊芳尹汤液论例扁鹊仲景例仲景阴证论例易老法霍乱吐泻足阳明总摄六经霍乱与少阴寒热同候叔和阴脉例活人阴脉
叙例言上卷人身阴阳五脏所生五脏所属五脏所藏五脏所主脏腑所合脏腑之官五藏九窍男女天癸血气所生营卫生会六经六气经气主治十二经脉冲任督带下卷全体总论五脏所伤五脏所恶脏腑为病诸病所属四时所病脏腑通治望形察色闻