序凡例卷一·慎疾法语省身修德卫生总要饮食宜忌养生铭保命箴寡欲说延年六字诀惜三宝益五脏先时加谨摄生要言勿药须知十二段动功行功六字静功解十二时病为善去疾吕祖治百病符卷二·杂症头疾面疾眼疾耳疾鼻病口病唇病舌
马序王序一夏序王序二曹序许序陶序秦序丁甘仁先生别传卷一伤寒案风温案暑温案湿温案痉症案卷二霍乱案泄泻案痢疾案疟疾案喉痧案附∶白喉案附∶痧后案卷三中风案类中案神志案内伤杂病案附∶不寐案附∶肝气肝阳案附∶头
万氏家传养生四要
十二经补泻温凉引经药歌
针经节要
序卷上定尺寸法点灸法下火法用火法候天色法定灸多少法定发际法发灸疮法淋洗灸疮法贴灸疮法人神所在不宜针灸每月忌日不宜针灸出血十二部人神不宜灸十二时忌不宜灸十二部年人神不宜灸九部旁通人神不宜灸杂忌旁通不宜灸
自序祝序一·辨诊脉大法二·辨浮脉所统有十三·辨沉脉所统有五四·辨迟脉所统有五五·辨数脉所统有二六·辨滑脉所统有一七·辨涩脉八·辨肺大肠脉九·辨心小肠脉十·辨脾胃脉十一·辨肝胆脉十二·辨肾膀胱脉十三·辨
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
神农本草经赞
裘序叶序原序卷上辨春夏秋冬温暑凉寒四证病原天时地气辨寒暑证各异暑证暑厥暑风暑疡暑瘵绞肠痧时疫（见朱丹溪）寒疫脉理五运六气五运配十干之年六气为司天之岁南政北政十二支年分运气增订客气客运活法卷中古今名医暑