序一序二序三凡例寒性药品苦参升麻葛根柴胡前胡甘草黄连黄芩黄柏知母干地黄熟地黄芍药（白赤）大黄青皮枳壳枳实猪苓泽泻木通栝蒌桑白皮葶苈子滑石薄荷防风天门冬麦门冬牡丹皮红蓝花苏木栀子桃仁连翘地榆石膏马兜铃枇
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
魏序凡例卷一水部（十四种）立春雨水露水冬霜腊雪水夏冰甘澜水逆流水井泉水地浆百沸汤阴阳水齑水磨刀水磨刀水火部艾火灯花土部（九种）黄土东壁土胡燕窠土蚯蚓泥乌爹泥伏龙肝乌古瓦墨百草霜金部（十七种）金箔银箔自
鲙残篇
自叙跋卷首六经解六气解营卫解风寒解传经解里气解卷一·太阳经风寒原委提纲 (卷一)太阳中风桂枝汤证太阳伤寒麻黄汤证太阳风寒两感桂麻各半汤证太阳风寒大青龙汤证衄血太阳伤寒小青龙汤证太阳风寒白虎汤证太阳伤寒
序按语八十五条附方
王序卷一四明心法（上）诊法脉义二十五方总图二十五方分图二十五方图解二十五方主症卷二四明心法（中）方论药论卷三四明心法（下）中风伤寒疟疾痢疾鼓症膈症吞酸眩晕咳嗽怔忡血症弱症消症霍乱胃脘痛胎前产后带下淋症
石药尔雅
制药法调经论胎前论胎前诸症胎前门主方加减活法胎前方诀产后产后门主方加减（载后）产后方诀万病回生丹治产后十八症乌金散治产后十八症黑虎丹治产后血症垂死者即生
原序潘序周序十药总论甲字十灰散乙字花蕊石散甲乙二方论丙字独参汤丙字人参汤论丁字保和汤戊字保真汤丁戊二汤方论己字太平丸己字太平丸论庚字沉香消化丸庚字消化丸论辛字润肺膏辛字润肺膏论壬字白凤膏癸字补髓丹平胃